En 2373, un accident projette l'USS Voyager NCC-74656 sur la Terre en 1996. A cette occasion, le programme Holographique Médical d'Urgence est doté par l'Amiral Henry Starling, informaticien de génie, d'un holoémetteur autonome créé grâce à la technologie du XXIXe siècle.
Ce holoémetteur est un petit appareil qui se porte sur la manche et permet de transmettre un programme holographique sans l'aide d'un quelconque matériel supplémentaire. La totalité du programme HMU de Voyager peut y être stockée, en conséquence, où qu'aille cet appareil, le programme HMU peut être lancé.
En résumé, le Docteur a la possibilité de se rendre là où nul HMU n'est jamais allé : hors du vaisseau. Aussi longtemps que le Docteur porte le holoémetteur et que celui-ci fonctionne, il est « libre comme l'air ».
Henry Starling modifie le programme HMU de façon que le Docteur soit sensible à la douleur et puisse donc être torturé. Il l'utilise en outre comme un bouclier contre les attaques menées par les membres d'équipage de Voyager, mais les aspects déplaisants de cette aventure sont compensés par sa conscience des possibilités immenses qu'offre l'appareil.
Malgré son total manque d'expérience, le Docteur se comporte admirablement. Il aide l'autre otage de Starling, Rain Robinson, à s'échapper et il arrache Chakotay et B'Elanna Torres aux griffes d'une milice indépendante.
Dans le mois qui suit, le Docteur étudie les instructions de Starfleet concernant les membres détachés en mission extérieure, dans l'espoir d'une nouvelle occasion de s'aventurer hors du vaisseau.
Date stellaire 50425 : De retour dans le quadrant Delta, le Docteur se porte volontaire pour effectuer une mission dans une mine Garane, où les prospecteurs sont atteints par un virus inconnu. C'est là une mission parfaite pour lui, non seulement parce qu'il est médecin, mais aussi parce qu'il ne peut être infecté. Le Docteur est ébahi de tout ce qu'il découvre dans les mines.
Dans un premier temps, Chakotay pense qu'il est trop distrait et lui demande de se concentrer sur les choses importantes, mais à la fin de la mission, le même Chakotay qualifie de tout à fait exemplaire le comportement du Docteur.
Date stellaire 50693 : Après que le Docteur ait tenté de se reprogrammer pour acquérir de meilleures qualités relationnelles avec ses patients, ses sous-programmes de personnalité se détériorent de façon imprévisible.
Fou de jalousie, il enlève Kes et se téléporte sur une planète où est implantée une colonie de Voyageurs Mikhals. Il y agresse un voyageur qui courtisait Kes, avant d'être ramené à bord du vaisseau et de retrouver son état normal. Cet incident, qui n'aura pas de conséquences permanentes, illustre néanmoins les inconvénients de cette mobilité nouvelle.
Un autre incident illustre bien les problèmes posés par l'holo-émetteur. A la date stellaire 51186, le Docteur prend part de nouveau à une mission hors du vaisseau. Voyager reçoit un signal de détresse d'un hologramme qui est l'unique « survivant » à bord d'un vaisseau Alien. Or, cet hologramme ou projection isomorphique est obsédé par la propreté et c’est en fait lui qui a causé la mort de l’ensemble de l'équipage. Il dérobe l'holo-émetteur du Docteur, ce qui lui procure la mobilité afférente, avant d'être arrêté par B'Elanna Torres.
Le Docteur a également eu l'occasion de jouer les héros. Lorsque l'équipage de Voyager est enlevé par les Nyriens, Chakotay parvient à emporter le holo-émetteur. Une fois l'appareil réactivé, B'Elanna modifie le programme du Docteur, de telle sorte qu'il remplit les fonctions d'un senseur de fortune. L'appareil lui permet de « voir » la sortie dissimulée de l'environnement scellé dans lequel se trouve l'équipage, qui réussit à s'enfuir.
La mission la plus spectaculaire et la plus importante accomplie par le HMU se présente quelques mois plus tard.
La refonte du laboratoire astrométrique de Seven of Nine conduit à la découverte d'un vaste réseau de stations de communications Aliens, dont la plus lointaine est à portée de senseur de l'USS Prometheus, un vaisseau de la Fédération voguant aux confins du quadrant Alpha.
Le Capitaine Kathryn Janeway propose d'envoyer le Docteur à 60000 années-lumière de distance par le biais de ce réseau, malgré le danger de perte de son programme, il accepte cette mission.
Le voyage dans le réseau fonctionne conformément aux espérances. Le HMU est chargé, intact, dans le système HMU amélioré, avec un code d'initialisation, il se matérialise bientôt à bord du vaisseau expérimental, où il va mener la mission la plus excitante et la plus dangereuse de sa courte « vie ».
Il rencontre un HMU de type II (un hologramme médical de nouvelle génération créé pour le Prometheus) et apprend que les Romuliens ont pris le contrôle du vaisseau et tué son équipage. Fort heureusement, il parvient à défaire les intrus et à parachever la mission qui lui a été confiée : la remise aux autorités de la Fédération d'un message concernant la survie de Voyager.
Selon les divers rapports, il est évident que le Docteur à grandement contribué au retour de l’USS Voyager dans le quadrant Alpha.